日本工作签证申请被拒签的原因有很多，具体原因取决于每个申请者的工作经验、资格及背景等，以下是常见原因：
一、审批人员认为该申请者不具备来日本工作所需的资格或能力；
二、审批人员认为申请者的申请目的是把日本当作临时性的住所，而不是真正的工作目的；
三、申请者未能提供满足审核要求的相关资料或申请材料；
四、申请者存在前科记录或其他安全危险；
五、申请者具有历史上和政府有关的不良活动；
六、申请者之前曾被拒签；
七、存在其他特殊原因。
对于被拒签，建议申请人可以对申请材料及其他资料加以完善和补充，并向日本使领馆申诉，以便可以尽快重新申请。
关于日本工作签证申请后被拒签的原因和处理建议扩展内容：
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日本工作签证申请被拒签的原因可能有很多，例如：
1.申请者个人信息不正确。例如：身份信息，国籍，教育，工作经历等均不符合要求；
2.申请者未提供有效的工作证明，如雇主出具的书面担保证明；
3.申请者未能提供充分的证明材料表明他/她有能力维持自己的生活；
4.申请者未能提供有效的健康证明或其他医疗资料。
处理建议：
1.应当仔细检查申请者的个人信息，确保准确无误；
2.应当提供充足有效的工作证明；
3.应当提供有效的资金证明文件，以证明自己有能力维持自己的生活；
4.应当提供健康证明文件，证明申请者在出国前没有任何健康问题；
5.如果由于任何原因未能获得签证，应当保留所有资料作为申请签证的证明，以便下次申请时能够更好地陈述自己的申请原因。